Kirurgisk hånddesinfektion bør følge princippet om "vask hænder først, derefter desinficere", så processen kan opdeles i to trin: håndvask og hånddesinfektion.

For det første trin "håndvask", er der intet krav om at vaske to gange.

For andet trin "hånddesinfektion" indføres to metoder:
① skyl hånddesinfektionsmetode, det vil sige tage hånddesinfektionsmidlet belagt og gnidt, skyl med rindende vand og tør, når rindende vand kvaliteten ikke opfylder kravene i GB5749-2006 "drikkevands hygiejnestandarder", kirurgen i handskerne før påføring af alkohol hånddesinfektionsmiddel og derefter desinficere hænderne efter brug af handsker.
② hånddesinfektionsmetoder, der ikke skylles, anvendelse af hånddesinfektionsmiddel, der ikke skylles, belagt og gnides, indtil desinfektionsmidlet er tørt.

Grunden til, at der er forvirring om, hvorvidt kirurgisk hånddesinfektion er en engangsvask eller to gange håndvask, er, at andet trin i "skyllemetoden til hånddesinfektion" kan forveksles med en anden "håndvask". Det andet trin kan forveksles med en anden "håndvask" i det andet trin, "skylning". Faktisk er formålet med dette trin imidlertid desinfektion, ikke rengøring, og det er ikke "håndvask".

Derfor er det normalt, uanset hvilken metode til hånddesinfektion der anvendes, kun nødvendigt at vaske hænderne én gang på forhånd. Men hvis hygiejnen er dårlig, og der er meget hudsnavs, anbefales vask to gange.